Giusto per non far pedere traccia di come ci si muove in Italia oggi:

Pezzo finale del discorso di Berlusconi:

Giudizio sul discorso di Berlusconi da parte dell’Italia dei Valori.

Fini, che non riesce a fare il presidente della camera.

ANTONIO DI PIETRO. Signor Presidente della Camera, darmi la
possibilità di parlare è un suo compito.
PRESIDENTE. Onorevole Di Pietro, lei non è nuovo di quest’Aula e sa
che è abbastanza naturale che ci sia, nei limiti…
ANTONIO DI PIETRO. Solo quando riguarda me, però.
PRESIDENTE. Ovviamente dipende unicamente da ciò che si dice (Applausi
dei deputati dei gruppo Popolo della Libertà e Lega Nord Padania)…
BRUNO TABACCI. Cosa vuol dire: «Dipende da cosa si dice»?
[...]
PIER FERDINANDO CASINI. Signor Presidente, proprio perché dissento
totalmente dalle cose che ha detto l’onorevoleDi Pietro, vorrei
ricordarle che i parlamentari non possono essere sindacati, fatti
ascoltare o meno a secondo di quello che dicono, altrimenti si apre un
precedente assai pericoloso (Applausi dei deputati dei gruppi Unione
di Centro, Partito Democratico e Italia dei Valori).

Di Pietro che dichiara che farà un’opposizione dura.

da Repubblica: “Da oggi ci sarà un’opposizione forte e senza
compromessi. Noi crediamo che lei si sia messo a fare politica per i
suoi interessi personali” conclude Di Pietro. Dai banchi del Pd nessun
applauso.

Il PD che semplicemente, non esiste.

Per inciso, alcune posizioni chiare sulla legge 194.

When I was at the predoc course in Heidelberg I saw that a lot of my friends, real experimental biologists, where a little bit confused in which tool use to do a bioinformatic job and where to grab it.

On top of that there was another problem that was related to the big number of bioinformatics software available out there and how to make a choice between them.

So I come up with the idea of the biocompass that I will try to explain.

Biocompass will be a web-portal where scientists can ask question about specific bioinformatics topic and other user can try to give an answer, giving the idea where it’s worth to look.

Let me try to explain it with some examples:

Sarah is an experimental biologist and she has a sequence of a DNA. She want to know if this sequence is a gene and, in that case, if it function is known. However she doesn’t know how to do it.

She comes to biocompass web-portal and post the question over there. The systems checks if there are similar questions already asked, if they are the system is going to show the first 5 hits that are similar to the problem proposed by Sarah.

If Sarah is satisfied with it, she will accept the answer and the system will store original question into the database for further reference and to increase the precision of the system.

In the other case Sarah decide to post the question to the attention of the other people subscribed to the portal.

The system will ask her to categorize the question into one of the available categories, like for example genetic, molecular dynamic, philogenetic, simulation, …

She will be guided through an easy but systematica process to end up with a really well organized entry.

The system will propose a set of tags already present in the database to atick them to the question, to have a more fine-grained search later on.

Now comes another important innovation about biocompass, the filtering. Nowadays there is too much information that cannot be processed in a reasonable amount of time. That’s why we need system to filter and select only the information that we really want to know.

Andrea is a bioinformatician working on genetic alignment. She has subscribed to biocompass and she decided to follow the genetic category only. This means that she is going to receive update only when there is a new question in the genetic category, ignoring all the others; they are not is field and she cannot be helpful over there.

Andrea sees the new question coming. She is following the new questions with a RSS feed that she prefer over the mail system.

She knows the answer. A BLAST search can give an hint about the DNA sequence. She suggest to use BLAST as a starting point for the research, linking it to the BLAST page entry.

This is an internal page in biocompass, where there is a small description about the software, the link to the ufficial website, and the number of user that have found the tool useful or not to solve this problem.

The rating is given by other user that has found the software good to solve this kind of problem, giving an idea how good and useful is the software itself.

The system shows also a bunch of related softwares that can be useful to solve this kind of question (ClustulW, BLAT, …)

Sarah gets the update from biocompass with the answer coming from Andrea. She now can start the investigation about her DNA sequence.

Here we are. Biocompass has act as a real compass, to give the direction where to start. This time the needle was pointing to BLAST direction, next time is going to point somewhere else.

This article is also at http://phdblog.scampsonline.org/

I finally managed to set up the page for the band.

It was really a pain and I’ve got an enormous number of errors when I was uploading images or songs.

I think it’s one of the most user unfriendly web site that I have ever had the chance to use and interact.

Anyway now you can enjoy the random simmetry songs directly from myspace. And even download them. Have fun.

Sono 30 anni che è morto Peppino Impastato.

Tuttavia il suo impegno antimafia non è scomparso. Ci sono tutti i ragazzi e le ragazze del movimento ammazzatecitutti che ogni giorno lottano contro la mafia.

Ora più di prima serve un’opinione pubblica attiva e sveglia. Ora che abbiamo il primo ministro che ha definito Mangano, un boss mafioso, un eroe.

E cosa può fare il cittadino?

Consumare criticamente

Come già detto. W l’Italia libera dalla mafia.

At the BioSysBio Conference which I have attended in London this April there was a lot of things going on. An interesting bit was the workshop on Openscience notebook, on which I am really interested and thrilled. I’ve touched this subject in the past, however I will blog about this later on.

At the social dinner there was an exhibition from some artists and designers from the London Royal College of Art.

Image source

That’s how I knew Tommaso and we started to speak about it. I gave my “scientific” point of view, mainly answering what is possible now, what will be possible in future and what, according to the accepted paradigma and the availability of informations is not possible at all.

The topic was trying to think about new concept ideas grounding them on a scientific point of view.

To be honest I always saw this kind of contamination between the two realities with a lot of interest.

I am quite convinced that a scientist discovers something not when he/she is in the lab, but when he/she is outside the lab. Of course the ability to test the idea and grounding it on the science bases with model,measures and a theory happens in the lab and research work, but the original concept, the main idea is a sum of some different stimuli coming from different sources where art play a really big part.

These projects seems to demonstrate that also the other way is possible and science can influence art and design in a really intriguing and prolific way.

Maybe the difference between humanistic subjects and scientific subjects is only a matter of language and convention, and the holy war that usually it’s on between this two fields it’s just a matter of misunderstanding.

It’s time to move foward and trying to rethink the association between the two fields. Also from a teaching point of view.

Donne nude?

No.

Nuovo ministro delle pari opportunità.

Qualcuno avrà sperimentato sicuramente la frustrazione di salvare una presentazione fatta con openoffice in odf, mandarla per mail o metterla su un sito e scoprire che “le immagini non si vedono”.

Siccome è un problema che mi affliggeva da oramai un paio di settimane ed esportare il tutto in pdf non era il caso a causa delle animazioni oggi mi ci sono messo di buzzo buono e ho trovato la soluzione.

Non è che sia un problema enorme, ma tuttavia nessuno s’era preso la briga di scriverlo ed allora eccoci quà.

Se stai ancora leggendo, significa che realmente vuoi mettere queste immagini allora screenshot:

Quella cerchiata in rosso è la casella da spuntare. Di default è selezionata.
Deselezionandola le immagini vengono salvate dentro il file e potete mandare la vostra fantastica presentazione per mail o metterla dove preferite.
HIH

Quando Einstein tira fuori la teoria della relatività generale non la capiva ancora nessuno, se non lui e Bohr.

Poi la cosa diventa abbastanza di moda, nessuno ci capisce ancora nulla, tuttavia la piaggio ci fa uno scooter, il glorioso NRG=mc²

Mi ricordo ancora il tentativo mio e di un amico di raccontare la relatività generale durante una settimana di autogestione al liceo.

L’esperimento teneva, avevamo una nicchia di pubblico, una cosa decente tipo non siamo tanti che facciamo paura, ma nemmeno siamo solo io e te e quindi chiudiamo.

Il punto era un nuovo approccio alla divulgazione scientifica ed il tentativo di raccontarla in maniera completamente diversa e divertente.

Infine oggi, m’imbatto su questo post su mentecritica, sulla relatività generale. Direi che è più o meno sulla stessa linea. Merita la lettura. Riprende alcuni esempi dalle lezioni di Richard Feyman.

Questo post è una reazione scatenata dal commento di katross sul blog del circolo berlinguer di Ancona appena aperto.

La domanda era perchè il Partito Democratico non ha detto nulla sul conflitto di interessi.

La risposta l’ha data Violante nel 2003 alla camera

Inoltre, giusto per capire chi sono Rutelli e Veltroni, ieri la Gabanelli ha fatto la classica puntata di report che ti getta nel classico sconforto lunediano.

E allora viva Berlusconi e Alemanno? No, ovviamente no, perchè anche questi non sono capaci. Oddio, ad essere sinceri Berlusconi è stato provato con effetti disastrosi, Alemanno è stato ministro in qualche governo Berlusconi e non mi sembra abbia brillato.

E quindi ritorniamo a Sinistra. Ops, ho detto sinistra, quella che difende la laicità dello stato, quella che pensa che l’equità sociale sia la base per una società giusta.

Quella del rispetto delle regole, quella che si cercano soluzioni con il dialogo e si arrivano a conclusioni, quella che pensa che la meritocrazia sia un valore e vada premiato.

Dov’è questa sinistra? Questa sinistra non è espressa a livello nazionale. Gli attuali dirigenti del partito democratico sono completamente fuori fase rispetto a quello che sono le esigenze della base.

E quindi che si fà?

Quindi si fa politica dal basso testardamente.

Che cos’è la politica? La politica è l’arte di rendere le cose
impossibili possibili cercando di mettere più o meno d’accordo tutti
con la forza degli argomenti.
La definizione è mia, just now.

Come?

Secondo la rivoluzione pigra del bradipo.

La rivalutazione del sistema locale a discapito della grande distribuzione

Ovvero attraverso iniziative concrete che vadano a risolvere problemi contigenti.

Lo sò, sembrano più iniziative da Meet-Up o da associazione consumatori che non vengono dibattuti all’interno dei circoli politici.

Qualcuno dovrebbe spiegarmi il perchè.

Invece si continua  solo a parlare del 21 che non viene rispettato, che sono passati sopra all’11 usando
eufemismi e che il 3 se ne è andato dopo la frase di Berlusconi di fronte al giudice. Questi risolvono problemi a livello sistemico, ma non locale. Ed ancora non abbiamo le leve per cambiarlo a livello globale. Quindi l’unica cosa sensata da fare è lavorare sul locale.

Possiamo continuare a giocare a fare Miss Mondo e dire che vogliamo
risolvere la fame nel mondo, oppure possiamo sotituire le lampadine al
tungsteno con quelle a fluorescenza. E’ questa l’idea base. Piccoli
pezzi e piccole azioni.

Ovviamente nella speranza che cambiando le lampadine……

Sono solo io, oppure youtube non è raggiungibile?

Update: Sembra andare ora